Les MAE s’inscrivent dans le cadre d’AREA. Ce programme permet aux exploitations de gérer et de valoriser les effluents, de rationner l’utilisation des produits phytosanitaires, d’économiser les ressources naturelles et d’utiliser plus largement les énergies renouvelables. 3500 exploitations agricoles se sont engagées dans la démarche depuis 2002. Les MAE viennent renforcer le dispositif.

Elles sont octroyées à l’hectare ou au mètre linéaire pour une durée de 5 ans. Ce programme d’aides incite les exploitants à intensifier la protection de la biodiversité, à améliorer la qualité des eaux superficielles et à préserver les ressources en eau potable dans les bassins versants.
La Région Aquitaine a par ailleurs voté l’octroi d’aides supplémentaires (
près de 250 000 euros) à la filière viticole pour ses programmes d’expérimentation sur la biodiversité végétale, la valorisation des effluents par le compostage ou encore les produits alternatifs pour protéger la vigne ; le Syndicat des vignerons bio d’Aquitaine a reçu une aide pour la réalisation d’une étude sur la présence de résidus pesticides dans les vins bio.